شناسایی مولکولی و تجزیه¬تحلیل تبارزایی ویروس موزاییک خیار زیرگروه IB جداشده از گیاه دارویی ختمی

ویروس موزاییک خیار Cucumber mosaic virus (CMV) ، از جنس Cucumovirus و خانواده Bromoviridae می­باشد. خَتمی (Althaea officinalis) گیاهی یک­ساله و خودرو از تیره پنیرکیان است که گل، میوه و ریشه آن مصارف دارویی دارد. در این تحقیق، پنج نمونه مشکوک به آلودگی با CMV از گیاه ختمی جمع­آوری و وجود CMV با آزمون­های سرولوژیکی از جمله DAS-ELISA ، از نمونه­ها ردیابی شد. از بین آن­ها، جدایه Ta-alth انتخاب و پس از استخراج RNA کل از گیاه آلوده به آن، با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ناحیه ژن پروتئین پوششی، RT-PCR انجام و قطعه 675 جفت بازی تکثیر شد. قطعه تکثیر شده درون پلاسمید  pTZ57R/T همسانه­سازی و سپس تبدیل سلول­های مستعد Escherichia coli  سویه DH5α انجام گردید. جهت حصول اطمینان از قرارگرفتن قطعه موردنظر درون حامل، تجزیه­تحلیل پلاسمید نوترکیب خالص­سازی­شده با استفاده از آنزیم­های برشی انجام و توالی قطعه تکثیری تعیین گردید. توالی به­دست­آمده با استفاده از برنامه GeneDoc با توالی­های متناظر سایر جدایه­های CMV از ایران و نقاط دیگر دنیا (موجود در بانک ژن) مقایسه و درخت تبارزایی با استفاده از روش Neighbor-Joining(NJ) و برنامه TREECON رسم گردید. تجزیه­تحلیل ترادف ژن پروتئین پوششی جدایهTa-alth  نشان داد که این جدایه متعلق به زیرگروه IB ویروس موزاییک خیار می­باشد. این اولین گزارش از آلودگی ختمی به CMV در ایران است.